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Endless lseek导致的SQL异常

最近碰到同事咨询的一个问题,在执行一个函数时,发现会一直卡在那里。

strace抓了下发现会话一直在执行lseek,大致情况如下:

16:13:55.451832 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000037>
16:13:55.477216 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000026>
16:13:55.502579 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000026>
16:13:55.528162 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000024>
16:13:55.553714 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000025>
16:13:55.579242 lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064 <0.000022>
......% time seconds usecs/call calls errors syscall
------ ----------- ----------- --------- --------- ----------------
0.00 0.000000 0 124 lseek
------ ----------- ----------- --------- --------- ----------------
100.00 0.000000 124 total

而当手动去取消掉会话时也能发现,是卡在了其中一个insert语句:

[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:13:24]M=# select pgawr_snap('cron based snapshot',59451);
^CCancel request sent
ERROR: 57014: canceling statement due to user request
CONTEXT: SQL statement "INSERT INTO pgawr_indexes
( snapid, idx_scan, idx_tup_read, idx_tup_fetch, idx_blks_read,
idx_blks_hit, index_name_id, table_name_id)
SELECT
spid as snapid,
i.idx_scan as idx_scan,
i.idx_tup_read as idx_tup_read,
i.idx_tup_fetch as idx_tup_fetch,
ii.idx_blks_read as idx_blks_read,
ii.idx_blks_hit as idx_blks_hit,
n1.nameid,
n2.nameid
FROM
pg_stat_all_indexes i
join pg_statio_all_indexes ii on i.indexrelid = ii.indexrelid
join pgawr_names n1 on i.schemaname ||'.'|| i.indexrelname=n1.name
join pgawr_names n2 on i.schemaname ||'.'|| i.relname=n2.name"
PL/pgSQL function pgawr_snap(character varying,bigint) line 104 at SQL statement
LOCATION: ProcessInterrupts, postgres.c:3203
Time: 203994.651 ms (03:23.995)

当然分析这种函数执行慢的,最常用的还是auto_explain,可以在会话中设置来打印函数中具体执行的情况:

load 'auto_explain';set client_min_messages='log';
set auto_explain.log_min_duration = 0;
set auto_explain.log_analyze = true;
set auto_explain.log_verbose = true;
set auto_explain.log_buffers = true;
set auto_explain.log_nested_statements = true;

根据上面得到的信息发现文件句柄33对应的恰好也是该SQL中的一张表,而lseek(33, 0, SEEK_END) = 1368064的返回值也的确是和该数据文件的大小一致,说明的确是扫描完该表了。

那就有点奇怪了,这个SQL也很简单,而且单独拿出来执行也都没问题,为什么会一直卡在lseek这个数据文件这里呢?

上网搜了下,发现有个类似的bug:BUG #15455: Endless lseek,其中的情况和我这个有些类似:

 

但是往后看了malilist里面的讨论也是不了了之,最终也没有个结论。。。

哎,没有办法,只能自己接着分析了。

为了方便查看,我这里把SQL简写了,insert也换成select。

[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:40:10]M=# EXPLAIN ANALYZE SELECT
->   i.idx_scan         as idx_scan,
->   i.idx_tup_read     as idx_tup_read,
->   i.idx_tup_fetch    as idx_tup_fetch,
->   ii.idx_blks_read   as idx_blks_read,
-> ii.idx_blks_hit    as idx_blks_hit,
->   n1.nameid
->  FROM
->   pg_stat_all_indexes i
->   join pg_statio_all_indexes ii on i.indexrelid = ii.indexrelid
->   join pgawr_names n1 on i.schemaname ||'.'|| i.indexrelname=n1.name;QUERY PLAN
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Nested Loop  (cost=1805.21..3055.18 rows=3 width=44) (actual time=0.381..0.384 rows=0 loops=1)Join Filter: ((((n.nspname)::text || '.'::text) || (i.relname)::text) = (n1.name)::text)->  Seq Scan on pgawr_names n1  (cost=0.00..228.00 rows=1 width=44) (actual time=0.380..0.381 rows=0 loops=1)->  Nested Loop  (cost=1805.21..2815.83 rows=502 width=136) (never executed)->  Hash Join  (cost=1804.92..2585.91 rows=502 width=140) (never executed)Hash Cond: (c.relnamespace = n.oid)->  Nested Loop  (cost=1801.01..2580.62 rows=502 width=80) (never executed)->  Hash Join  (cost=1800.73..2057.32 rows=900 width=12) (never executed)Hash Cond: (x.indexrelid = x_1.indexrelid)->  Hash Join  (cost=766.65..1005.74 rows=2267 width=8) (never executed)Hash Cond: (x.indrelid = c.oid)->  Seq Scan on pg_index x  (cost=0.00..224.09 rows=5709 width=8) (never executed)->  Hash  (cost=715.81..715.81 rows=4067 width=8) (never executed)->  Seq Scan on pg_class c  (cost=0.00..715.81 rows=4067 width=8) (never executed)Filter: (relkind = ANY ('{r,t,m}'::"char"[]))->  Hash  (cost=1005.74..1005.74 rows=2267 width=4) (never executed)->  Hash Join  (cost=766.65..1005.74 rows=2267 width=4) (never executed)Hash Cond: (x_1.indrelid = c_1.oid)->  Seq Scan on pg_index x_1  (cost=0.00..224.09 rows=5709 width=8) (never executed)->  Hash  (cost=715.81..715.81 rows=4067 width=8) (never executed)->  Seq Scan on pg_class c_1  (cost=0.00..715.81 rows=4067 width=8) (never executed)Filter: (relkind = ANY ('{r,t,m}'::"char"[]))->  Index Scan using pg_class_oid_index on pg_class i  (cost=0.29..0.58 rows=1 width=68) (never executed)Index Cond: (oid = x.indexrelid)->  Hash  (cost=2.85..2.85 rows=85 width=68) (never executed)->  Seq Scan on pg_namespace n  (cost=0.00..2.85 rows=85 width=68) (never executed)->  Index Only Scan using pg_class_oid_index on pg_class i_1  (cost=0.29..0.46 rows=1 width=4) (never executed)Index Cond: (oid = i.oid)Heap Fetches: 0

可以看到卡住的SQL拿出来单独执行是没有问题的,但是仔细观察可以发现,该执行计划中很多never executed的节点,说明下面的这些部分实际都没有执行,那是因为pgawr_names这张表是空的,因此对于这个嵌套循环来说,被驱动的部分其实就没有必要执行了。

而查看完该函数的内容之后发现,在执行这个SQL之前是有往pgawr_names这张表里面插入数据的。

这样一下子就有思路了:因为在同一个会话中,前一条SQL往pgawr_names表里面插入了大量数据,而表的统计信息在会话提交前是不会更新的。

[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:54:40]M=# begin;
BEGIN
Time: 0.128 ms[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:55:11]M=# select n_live_tup,last_analyze from pg_stat_all_tables where relname = 'pgawr_names';
n_live_tup | last_analyze
------------+-------------------------------
0 | 2023-02-22 15:09:43.348236+08
(1 row)Time: 11.319 ms
[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:55:27]M=# insert into pgawr_names (name)
-> select distinct i.schemaname ||'.'|| i.indexrelname
-> from pg_stat_all_indexes i
-> left join pgawr_names on i.schemaname ||'.'|| i.indexrelname=name
-> where
-> name is null;
INSERT 0 5709
Time: 207.526 ms[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:55:41]M=# ANALYZE pgawr_names ;
ANALYZE
Time: 73.666 ms[postgres@xxx/(rasesql)himsdpsods][02-22.16:55:46]M=# select n_live_tup,last_analyze from pg_stat_all_tables where relname = 'pgawr_names';
n_live_tup | last_analyze
------------+-------------------------------
0 | 2023-02-22 15:09:43.348236+08
(1 row)Time: 0.876 ms

既然如此,看来前面看到的会话一直卡在lseek其实是执行计划后面的嵌套循环太多导致的,我们可以把pgawr_names表中手动插入较少的数据来验证下:

[postgres@xxx:6266/(rasesql)himsdpsods][02-22.17:02:00]M=# begin;
BEGIN
Time: 0.141 ms
[postgres@xxx:6266/(rasesql)himsdpsods][02-22.17:02:02]M=# select n_live_tup,last_analyze from pg_stat_all_tables where relname = 'pgawr_names';n_live_tup |         last_analyze
------------+-------------------------------0 | 2023-02-22 17:01:53.272047+08
(1 row)Time: 11.615 ms
[postgres@xxx:6266/(rasesql)himsdpsods][02-22.17:02:03]M=# insert into pgawr_names(name) select md5(random()::text) from generate_series(1,200);
INSERT 0 200
Time: 52.083 ms
[postgres@xxx:6266/(rasesql)himsdpsods][02-22.17:02:28]M=# EXPLAIN ANALYZE SELECT
->   i.idx_scan         as idx_scan,
->   i.idx_tup_read     as idx_tup_read,
->   i.idx_tup_fetch    as idx_tup_fetch,
->   ii.idx_blks_read   as idx_blks_read,
-> ii.idx_blks_hit    as idx_blks_hit,
->   n1.nameid
->  FROM
->   pg_stat_all_indexes i
->   join pg_statio_all_indexes ii on i.indexrelid = ii.indexrelid
->   join pgawr_names n1 on i.schemaname ||'.'|| i.indexrelname=n1.name;QUERY PLAN
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Nested Loop  (cost=1805.21..3055.18 rows=3 width=44) (actual time=5618.220..5618.229 rows=0 loops=1)Join Filter: ((((n.nspname)::text || '.'::text) || (i.relname)::text) = (n1.name)::text)Rows Removed by Join Filter: 1141800->  Seq Scan on pgawr_names n1  (cost=0.00..228.00 rows=1 width=44) (actual time=0.014..0.417 rows=200 loops=1)->  Nested Loop  (cost=1805.21..2815.83 rows=502 width=136) (actual time=0.071..26.143 rows=5709 loops=200)->  Hash Join  (cost=1804.92..2585.91 rows=502 width=140) (actual time=0.069..16.342 rows=5709 loops=200)Hash Cond: (c.relnamespace = n.oid)->  Nested Loop  (cost=1801.01..2580.62 rows=502 width=80) (actual time=0.068..14.519 rows=5709 loops=200)->  Hash Join  (cost=1800.73..2057.32 rows=900 width=12) (actual time=0.066..4.280 rows=5709 loops=200)Hash Cond: (x.indexrelid = x_1.indexrelid)->  Hash Join  (cost=766.65..1005.74 rows=2267 width=8) (actual time=0.028..2.815 rows=5709 loops=200)Hash Cond: (x.indrelid = c.oid)->  Seq Scan on pg_index x  (cost=0.00..224.09 rows=5709 width=8) (actual time=0.002..0.833 rows=5709 loops=200)->  Hash  (cost=715.81..715.81 rows=4067 width=8) (actual time=5.083..5.085 rows=4070 loops=1)Buckets: 4096  Batches: 1  Memory Usage: 191kB->  Seq Scan on pg_class c  (cost=0.00..715.81 rows=4067 width=8) (actual time=0.010..4.506 rows=4070 loops=1)Filter: (relkind = ANY ('{r,t,m}'::"char"[]))Rows Removed by Filter: 6170->  Hash  (cost=1005.74..1005.74 rows=2267 width=4) (actual time=7.443..7.445 rows=5709 loops=1)Buckets: 8192 (originally 4096)  Batches: 1 (originally 1)  Memory Usage: 265kB->  Hash Join  (cost=766.65..1005.74 rows=2267 width=4) (actual time=4.328..6.637 rows=5709 loops=1)Hash Cond: (x_1.indrelid = c_1.oid)->  Seq Scan on pg_index x_1  (cost=0.00..224.09 rows=5709 width=8) (actual time=0.005..1.006 rows=5709 loops=1)->  Hash  (cost=715.81..715.81 rows=4067 width=8) (actual time=4.312..4.313 rows=4070 loops=1)Buckets: 4096  Batches: 1  Memory Usage: 191kB->  Seq Scan on pg_class c_1  (cost=0.00..715.81 rows=4067 width=8) (actual time=0.009..3.746 rows=4070 loops=1)Filter: (relkind = ANY ('{r,t,m}'::"char"[]))Rows Removed by Filter: 6170->  Index Scan using pg_class_oid_index on pg_class i  (cost=0.29..0.58 rows=1 width=68) (actual time=0.001..0.001 rows=1 loops=1141800)Index Cond: (oid = x.indexrelid)->  Hash  (cost=2.85..2.85 rows=85 width=68) (actual time=0.038..0.039 rows=85 loops=1)Buckets: 1024  Batches: 1  Memory Usage: 17kB->  Seq Scan on pg_namespace n  (cost=0.00..2.85 rows=85 width=68) (actual time=0.010..0.023 rows=85 loops=1)->  Index Only Scan using pg_class_oid_index on pg_class i_1  (cost=0.29..0.46 rows=1 width=4) (actual time=0.001..0.001 rows=1 loops=1141800)Index Cond: (oid = i.oid)Heap Fetches: 1141800Planning Time: 3.383 msExecution Time: 5618.715 ms
(38 rows)Time: 5623.090 ms (00:05.623)

发现果然如此,仅仅插入了200条数据而已,循环次数就达到了1141800次(5709*200)。而在原先的函数中往pgawr_names表中插入了有5000多条数据,这意味着至少要循环1千万次,这也是为什么会觉得SQL一直卡住在执行lseek的原因了。

回头再去看BUG #15455: Endless lseek,其实也是类似的原因,由于在会话中表数据量变化较多,而统计信息无法更新,同时SQL中有嵌套循环,导致性能异常,陷入了endless lseek中。

 

对此我们需要注意了,如果在同一个事务中先对某张表进行大量的增删操作,又由于其统计信息在事务结束前是不会更新的,而恰好该事务后面又有相关查询使用了该表,可能会对性能产生巨大影响,而如果该SQL中又包含较多嵌套循环,那么你也可能陷入看上去无休无止的lseek中了~

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一、下载mongoDB包 下载地址&#xff1a; https://www.mongodb.com/try/download/community 个人建议&#xff1a;如果是学习阶段&#xff0c;使用5以下版本更好些。 二、安装及配置 1、安装 # 1、解压 $ tar -zxvf mongodb-linux-x86_64-rhel70-4.4.19-rc1.tgz# 2、迁移目…...

掌握MySQL分库分表(七)广播表、绑定表实战,水平分库+分表实现及之后的查询和删除操作

文章目录什么是广播表广播表实战数据库配置表Java配置实体类配置文件测试广播表水平分库分表配置文件运行测试什么是绑定表&#xff1f;绑定表实战配置数据库配置Java实体类配置文件运行测试水平分库分表后的查询和删除操作查询操作什么是广播表 指所有的分片数据源中都存在的…...

企业为什么需要数据可视化报表

数据可视化报表是在商业环境、市场环境已经改变之后&#xff0c;发展出来为当前企业提供替代解决办法的重要方案。而且信息化、数字化时代&#xff0c;很多企业已经进行了初步的信息化建设&#xff0c;沉淀了大量业务数据&#xff0c;这些数据作为企业的资产&#xff0c;是需要…...