【BME2112】w11 notes

下周做老鼠实验

1. group analysis
   SPM group analysis
   数据地址
2. resting state 可以分析：correlation 计算两个脑区的相关性
   静息态实验简单
3. functional
   • 成功的实验能看到激活区
   • 不成功的实验：比如被试头动太大，不是健康的被试
4. Spontaneous brain activity 自发性脑活动
5. resting state FC
   头动信号很大的时候，会掩盖bold信号，呈现出相关性很大
6. correspondence with electrophysiology
7. resting-state networks resemble task-activated networks
8. correspondence with anatomic connectivity 不是完全对应是相关
   胼胝体的白质纤维束，连接左右脑
   选择不同区域作为种子区域（LP，V1，HF。。。）
9. default model network
   什么都没做的时候
   任务态信号差别一般在1%，静息态可能不到0.5%
10. 计算脑网络的方法
    • seed-based correlation
      加一个阈值，高的区域可以单独显示出来
      如何选seed？（ppt上有4种 atlas，published coordinate， structural image， activation map）
      可以是解剖学的区域 i.e.,视皮层
      脑区边界 相关性会很sharp
    • 独立主成分分析
      activation map分解成component i.e., matlab中的gift
      ICA reveals structured nerual & artifact patterns 可以分离噪声
      传统分析都要去掉脑室，但是研究脑脊液的论文不去掉脑室
    • TE dependent
11. graph analysis of whole brain network
    threshold 是需要试着去选取的，一开始不知道，选取效果最好的
12. Resting-state fMRI：power but ambiguous（模糊的）
    信号的来源是很多的 除了神经信号，还有头动，呼吸等等
13. what is noise，what is signal？
14. 头动处理方法不同，结果也很大不同
15. global signal 高人不那么清醒，与呼吸也相关
16. dpabi
    sub01_1
    sub01_2
    2个session 不支持bid格式