R语言【CoordinateCleaner】——cc_gbif(): 根据通过 method 参数定义的方法，删除或标记地理空间中异常值的记录。

cc_gbif()是R语言包coordinatecleaner中的一个函数，用于清理GBIF（全球生物多样性信息设施）数据集的地理坐标。该函数可以识别潜在的坐标错误，并对其进行修正或删除。

以下是cc_gbifl()函数的一般用法和主要参数：

cc_gbif(data, species = NULL, geometry = c("point", "polygon"), geometry_column = NULL, latitude_column = "decimalLatitude", longitude_column = "decimalLongitude", coordinate_precision_column = NULL, bounding_box = NULL, geographic_extent = NULL, keep_records_without_coordinates = TRUE)

参数说明：

• data: 输入的数据框或数据表，包含GBIF数据集。
• species: 可选参数，用于筛选特定物种的观测记录。默认为NULL，表示使用所有物种的记录。
• geometry: 指定数据集的几何类型，可以是"point"（点）或"polygon"（多边形）。如果数据集是点集，则几何类型应设置为"point"。如果数据集是多边形（如网格区域），则几何类型应设置为"polygon"。默认为"point"。
• geometry_column: 数据集中存储几何信息的列名。默认为NULL，表示函数将自动检测列名。
• latitude_column: 纬度信息所在的列名，默认为"decimalLatitude"。
• longitude_column: 经度信息所在的列名，默认为"decimalLongitude"。
• coordinate_precision_column: 坐标精度信息所在的列名，用于检测坐标错误。默认为NULL，表示不使用该列进行错误检测。
• bounding_box: 可选参数，指定限制数据集的边界框（经度范围和纬度范围）。默认为NULL，表示不限制边界框。
• geographic_extent: 可选参数，指定限制数据集的地理范围（国家、大陆等）。默认为NULL，表示不限制地理范围。
• keep_records_without_coordinates: 一个逻辑值，表示是否保留没有坐标信息的记录。默认为TRUE，即保留这些记录。

函数功能：

cc_gbif()函数用于对GBIF数据集进行清理和修正，以消除潜在的坐标错误。它可以识别并修复以下类型的坐标问题：

1. 重复的坐标：如果数据集中存在相同的坐标点，函数会将其合并为一个唯一的坐标点。
2. 空白坐标：如果数据集中存在缺失的坐标点，函数会删除这些记录。
3. 错误的坐标范围：函数会通过比较坐标点与世界各地的实际范围进行验证，并删除超出范围的记录。
4. 错误的坐标精度：如果提供了坐标精度信息（通过coordinate_precision_column参数），函数会根据精度信息检测可能的坐标错误，并进行修正或删除。

cc_gbif()函数是R语言包coordinatecleaner中的一个功能强大的函数，用于清理GBIF数据集中的地理坐标。它可以识别并修复重复的坐标点、空白的坐标点以及超出范围的坐标记录。此外，该函数还可以利用提供的坐标精度信息来检测可能的坐标错误，并进行修正或删除。

使用cc_gbif()函数时，用户可以通过指定特定物种的观测记录、几何类型（点或多边形）、存储几何信息的列名等参数来定制化处理。还可以选择限制数据集的边界框或地理范围。函数还提供了一个选项，决定是否保留没有坐标信息的记录。

通过使用cc_gbif()函数，用户可以有效地清理和纠正GBIF数据集中的地理坐标，提高数据的质量和准确性。这对于生物多样性研究、生态分析和地理信息系统应用都非常有价值。