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AI预测小分子与蛋白的相关特征： MegaMolBART, MoFlow，ESM-1, ESM-2

news 文章来源：https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/137735390 2024/11/1 3:27:19

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow

1）MegaMolBART
https://github.com/NVIDIA/MegaMolBART
基于 SMILES 的小分子药物发现与化学信息学深度学习模型。

2）MoFlow
https://github.com/calvin-zcx/moflow
用flow流方式分子生成

2、蛋白质：ESM-1, ESM-2

https://github.com/facebookresearch/esm
两个都是META对蛋白质相关的transformer模型

在这里插入图片描述

pip install fair-esm # latest release, OR:
pip install git+https://github.com/facebookresearch/esm.git # bleeding edge, current repo main branch

安装上面esm包后，可以通过下面esm-extract命令行提取蛋白的特征向量

esm-extract esm2_t33_650M_UR50D examples/data/some_proteins

AI预测小分子与蛋白的相关特征： MegaMolBART, MoFlow，ESM-1, ESM-2

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow 1）MegaMolBART https://github.com/NVIDIA/MegaMolBART 基于 SMILES 的小分子药物发现与化学信息学深度学习模型。 2）MoFlow https://github.com/calvin-zcx/moflow 用flow流方式分子生成 2、蛋白质：ESM-1, ESM-2 https://github.com/fa…...

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uniapp：uview-plus的一些记录

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文章目录前言OLTP 和 OLAPSMP 和 MPPlambda 架构Kappa 架构前言本文我们将研究不同类型的大数据架构设计，将讨论 OLTP 和 OLAP 的系统设计，以及有效处理数据的策略包括 SMP 和 MPP 等概念。然后我们将了解经典的 Lambda 架构和 Kappa 架构。 OLTP …...

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步骤大全：网站建设3个基本流程详解

一.领取一个免费域名和SSL证书，和CDN 1.打开网站链接：https://www.rainyun.com/z22_ 2.在网站主页上，您会看到一个"登陆/注册"的选项。 3.点击"登陆/注册"，然后选择"微信登录"选项。 4.使用您的…...

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武汉网页制作培训多少钱/windows优化大师win10

问题描述用微信的签名校验工具，结果是一致的。百度了一些相同的问题，很多都是说前端传过来的URL需要decode一下，但是我们的URL是前端只需要传一个path过来，然后我再拼接好给他传回去，所以不应该出现这种问题的啊相关代…...

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空间站参考消息/免费发布信息不收费的网站

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HTTP和MQTT协议实践一、REST协议实现1. 读取指定城市的天气预报信息2. 给指定手机号码发送验证码二、MQTT协议实现1. MQTT协议处于哪一层2. 自定义天气预报消息主题三、总结与参考资料一、REST协议实现任务要求一安装Java开发环境和Java IDE编程工具 Eclipse 或 IDEA&#xf…...

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编程日记 2024/10/31 14:27:42

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow

2、蛋白质：ESM-1, ESM-2

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