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免费生物蛋白质的类chatgpt工具助手copilot：小分子、蛋白的折叠、对接等

news 文章来源：https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/139361681 2025/2/2 7:01:42

参考：
https://310.ai/copilot

可以通过自然语言对话形式实现小分子、蛋白质的相关处理：生成序列、折叠等

应该是agent技术调用不同工具实现

  1. 从UniProt数据库中搜索和加载蛋白质。
  2. 使用ESM Fold方法折叠蛋白质。
  3. 使用310.ai基础模型设计新蛋白质。
  4. 使用TM-Align方法比较蛋白质。
  5. 利用ProteinMPNN模型进行蛋白质逆折叠。
  6. 聚焦并可视化蛋白质结构的特定部分。
  7. 生成报告并导出结果。 例如： - 查找结合锌且序列长度小于300的蛋白质。 - 折叠序列"DIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQ"。 - 设计包含特定功能的新蛋白质。 - 比较两个或多个蛋白质。 - 使用ProteinMPNN重新设计蛋白质。 - 高亮显示特定残基范围。 - 导出结果报告。

在线体验：

https://310.ai/copilot

小分子查找
在这里插入图片描述
蛋白质PDB查找
在这里插入图片描述

ProteinMPNN生成蛋白质序列
在这里插入图片描述
ESMFold进行蛋白序列的折叠<

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