当前位置: 首页 > news >正文

Pymol开源版安装 新版 3.0 / 3.1 Windows安装Pymol开源版

PyMOL 简介

PyMOL 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3D图像。多年来,PyMOL不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。

PyMOL 3.0 / 3.1 的安装

安装 PyMOL 3.0 或 3.1 非常简单,可以在 Windows、macOS 和 Linux 等各种操作系统上进行。以下是最新版本 PyMOL 的安装步骤。

在 Windows 上安装 PyMOL 3.0 / 3.1
  1. 下载安装程序: 访问 PyMOL 网站 并下载 Windows 安装程序。
  2. 运行安装程序: 双击下载的文件,按照安装向导进行操作。
  3. 完成安装: 安装完成后,可以从开始菜单或桌面快捷方式启动 PyMOL。

这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。

在 macOS 上安装 PyMOL 3.0 / 3.1
  1. 下载安装程序: 访问 PyMOL 网站 并下载 macOS 安装程序。
  2. 打开安装程序: 双击下载的 .dmg 文件,将 PyMOL 拖动到应用程序文件夹。
  3. 启动 PyMOL: 打开应用程序文件夹,双击 PyMOL 启动应用程序。

这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。

解法:通过其他方式去安装开源的版本,windows安装开源的版本可以通过Minconda来进行,但是mac并不适用。


PyMOL 2.6 与 PyMOL 3.1 的对比

1. 用户界面和可用性:

  • PyMOL 2.6: 界面功能强大,但设计较旧,对于新用户可能不太直观。
  • PyMOL 3.1: 这一版本引入了更为精致和用户友好的界面,提升了可用性,使用户更容易导航和执行任务。

2. 性能提升:

  • PyMOL 2.6: 性能稳定,能够满足大多数分子可视化任务的需求。
  • PyMOL 3.1: 在渲染速度和整体性能方面有显著提升,特别是在处理大型分子结构时。

3. 新功能:

  • PyMOL 2.6: 基本的分子可视化功能,支持插件和脚本。
  • PyMOL 3.1: 引入了新的可视化技术,更好地支持现代图形硬件,增强了脚本功能。

4. 支持和更新:

  • PyMOL 2.6: 作为旧版本,支持和更新有限。
  • PyMOL 3.1: 活跃的支持和频繁的更新,确保与最新的操作系统和硬件兼容。

结论

安装好后如下:

从 PyMOL 2.6 升级到 PyMOL 3.1 带来了许多改进,包括更好的性能、更直观的界面和新功能,提升了分子可视化体验。PyMOL 3.0 / 3.1 的安装过程在不同操作系统上都很简单,使其在科学社区中得到广泛应用。如果您仍在使用旧版本,强烈建议升级以利用这些增强功能。

相关文章:

Pymol开源版安装 新版 3.0 / 3.1 Windows安装Pymol开源版

PyMOL 简介 PyMOL 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3D图像。多年来,PyMOL不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。 PyMOL 3.0 / 3.1…...

记录一次环境的安装

目录 新添加的代码 代码解释 为啥ubuntu用debian软件源 为啥修改sources.list.d S权限意思 php缺少和数据库连接的模块 使用root登陆数据库1698错误 字段解释 auth_socket解释 使用root登陆数据库方法 详细解释 首先在安装的时候,有一个dockerfile文件&a…...

浏览器用户文件夹详解 - WebData(八)

1.WebData简介 1.1 什么是WebData文件? WebData文件是Chromium浏览器中用于存储用户表单数据、自动填充信息和支付信息的一个重要文件。每当用户在浏览器中填写表单或保存支付信息时,这些数据都会被记录在WebData文件中。通过这些记录,浏览…...

ijkplayer 自定义协议播放加密内容 Android

想对播放的音视频进行加密,防止资源被盗用,该怎么办呢? 这篇文章从自定义协议的角度来提供一中实现思路。在 ijkplayer 的基础上,通过实现自定义协议对文件进行解密。边解边播,以此为基础,还可以实现在线资…...

【kill】Centos/Linux 如何杀死那该死的进程?

简介 系统版本:Centos7.6 kill 命令发送指定的信号到指定的进程或者进程组。如果该信号没有指定,则发送SIGTERM信号(15),即终止信号。如果SIGTERM信号(15)无法终止,可使用SIGKILL&am…...

Cadence23学习笔记(十七)

吴老师的网站里面有很多cadence的开源项目,可以用来学习: 全志 H3 SOC 官方参考设计 DD3 16bitX2 原理图及PCB – 吴川斌的博客 (mr-wu.cn) cadence设置显示实时的走线长度: 在allegro进行布线时可以实时显示当先布线的实际长度有助于pcb的…...

WinFrom调用webapi接口方法及其应用实例

1.WinFrom调用webapi接口方法 最近项目要在winfrom项目中调用webAPI&#xff0c;故在网上查找资料&#xff0c;找到了一个WinFrom调用webapi接口的通用方法&#xff0c;关键代码&#xff1a; #region WinFrom调用webapi接口通用方法private async Task<string> InvokeWe…...

智能巡检企业级域名 SSL 证书

一、概述 SSL 证书是一种数字证书&#xff0c;用于在用户和服务器之间建立加密链接&#xff0c;确保数据传输的安全性&#xff0c;防止数据在传输过程中被截获或篡改。SSL 证书不仅保护了数据传输过程中的隐私和完整性&#xff0c;还可以帮助验证网站的身份&#xff0c;防止钓…...

海思35XX系列(三)sensor(传感器)

刚开始接触这个概念的时候感觉比较模糊&#xff0c;简单记录一下吧 Sensor&#xff08;传感器&#xff09;是一种可以感知外部环境并将感知到的信息转化为可用的电信号或其他形式的工具。传感器广泛应用于电子设备、工业自动化、汽车、医疗器械等领域&#xff0c;用于测量、监…...

dfs(续做)

1.混境之地5 #include<bits/stdc.h> using namespace std; typedef long long ll; const int dx[4] {0,1,0,-1}; const int dy[4] {1,0,-1,0}; int n,m,k,a,b,c,d,sign0; int h[1010][1010],visit[1010][1010]; void dfs(int x,int y,bool used) {if(xc&&yd){si…...

OpenStack;异构算力网络架构;算力服务与交易技术;服务编排与调度技术

目录 OpenStack 一、OpenStack概述 二、OpenStack的主要组件及功能 三、OpenStack的架构 四、OpenStack的应用场景 异构算力网络架构 算力服务与交易技术 服务编排与调度技术 OpenStack 是一个开源的云计算管理平台项目,由NASA(美国国家航空航天局)和Rackspace合作…...

PLC-Recorder对于数据采集时间戳偏差的修正功能

目录 一、修正原理 二、使用步骤 1、初始状态&#xff0c;计算修正系数 2、启动和使用 3、修正系数的手动修改 三、修正前后的效果对比 1、修正前的时间偏差曲线 2、修正后的效果曲线 四、注意事项 1、控制器可能的时钟波动 2、平移参数评估 3、参数保存 五、关于…...

自定义监控

代码说明&#xff1a; 导入必要的库 import time import psutil import GPUtil from prometheus_client import start_http_server, Summary, Counter, Gaugepsutil&#xff1a;用于获取系统的CPU、内存、磁盘和网络信息。GPUtil&#xff1a;用于获取GPU信息。prometheus_cli…...

关于使用php的mpdf插件遇到的一些问题

一.插件版本 "mpdf/mpdf": "^8.0", 二.报错&#xff1a;Undefined index: list_style_type 这个是插件无法识别 li 标签导致&#xff0c;生成pdf是加入下面代码 <style> li { list-style-type: none; list-style-image: none; list-style-positi…...

电脑截图,颜色变淡的问题解决

解决 Windows 11 在 HDR 模式下截图 Edge 浏览器界面时画面过曝的问题-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com) 主要是浏览器用错了东西&#xff0c;调一下就好&#xff0c;详情看链接 联想拯救者y9000p为例&#xff0c;选择sRGB&#xff0c;就好啦&#xff0c;拜拜喽&#x…...

uniApp跳转外链

创建一个新的页面&#xff0c;在该页面中使用web-view组件加载外部URL&#xff1a;pages/web-view/web-view <template><view><uni-list><uni-list-itemtitle"打开外部链接"click"openExternalLink"></uni-list-item></…...

科技云报道:大模型引领技术浪潮,AI安全治理面临“大考”

科技云报道原创。 从文生文到文生图&#xff0c;再到文生视频&#xff0c;近年来&#xff0c;以ChatGPT、Sora等为代表的大模型引领了全球人工智能技术与产业的新一轮浪潮。2024年更是被业内称为大模型应用爆发元年。 年初&#xff0c;Sora横空出世验证了Scalling Law在视频生…...

SpringSecurity+Mysql数据库实现用户安全登录认证

Spring Security 是一个提供身份认证、授权和防范常见攻击的安全权限框架。无论是对命令式&#xff0c;还是响应式web应用程序都完美支持&#xff0c;现在主要用作保护基于 Spring 框架的应用程序的事实标准。相对于shiro来说&#xff0c;SpringSecurity功能更加复杂而且更加强…...

虚拟网卡添加ip

1.虚拟机网卡添加 1.进入虚拟机设置添加网卡即网络适配器 2.配置文件修改 1.查看网卡是否添加成功 ip ad ifconfig 其中ens161就是我们新添加的设备同时这个ens161也是我们硬件名字 2.进入系统配置文件 cd /etc/sysconfig/network-scripts/#配置文件目录[rootlocalhost ne…...

Unity向量线性插值Lerp

inline glm::vec3 Lerp(glm::vec3 start, glm::vec3 end, float t){t glm::clamp(t, 0.0f, 1.0f);return (start*(1-t)end*t); }...

Vue记事本应用实现教程

文章目录 1. 项目介绍2. 开发环境准备3. 设计应用界面4. 创建Vue实例和数据模型5. 实现记事本功能5.1 添加新记事项5.2 删除记事项5.3 清空所有记事 6. 添加样式7. 功能扩展&#xff1a;显示创建时间8. 功能扩展&#xff1a;记事项搜索9. 完整代码10. Vue知识点解析10.1 数据绑…...

日语学习-日语知识点小记-构建基础-JLPT-N4阶段(33):にする

日语学习-日语知识点小记-构建基础-JLPT-N4阶段(33):にする 1、前言(1)情况说明(2)工程师的信仰2、知识点(1) にする1,接续:名词+にする2,接续:疑问词+にする3,(A)は(B)にする。(2)復習:(1)复习句子(2)ために & ように(3)そう(4)にする3、…...

【大模型RAG】Docker 一键部署 Milvus 完整攻略

本文概要 Milvus 2.5 Stand-alone 版可通过 Docker 在几分钟内完成安装&#xff1b;只需暴露 19530&#xff08;gRPC&#xff09;与 9091&#xff08;HTTP/WebUI&#xff09;两个端口&#xff0c;即可让本地电脑通过 PyMilvus 或浏览器访问远程 Linux 服务器上的 Milvus。下面…...

[ICLR 2022]How Much Can CLIP Benefit Vision-and-Language Tasks?

论文网址&#xff1a;pdf 英文是纯手打的&#xff01;论文原文的summarizing and paraphrasing。可能会出现难以避免的拼写错误和语法错误&#xff0c;若有发现欢迎评论指正&#xff01;文章偏向于笔记&#xff0c;谨慎食用 目录 1. 心得 2. 论文逐段精读 2.1. Abstract 2…...

优选算法第十二讲:队列 + 宽搜 优先级队列

优选算法第十二讲&#xff1a;队列 宽搜 && 优先级队列 1.N叉树的层序遍历2.二叉树的锯齿型层序遍历3.二叉树最大宽度4.在每个树行中找最大值5.优先级队列 -- 最后一块石头的重量6.数据流中的第K大元素7.前K个高频单词8.数据流的中位数 1.N叉树的层序遍历 2.二叉树的锯…...

libfmt: 现代C++的格式化工具库介绍与酷炫功能

libfmt: 现代C的格式化工具库介绍与酷炫功能 libfmt 是一个开源的C格式化库&#xff0c;提供了高效、安全的文本格式化功能&#xff0c;是C20中引入的std::format的基础实现。它比传统的printf和iostream更安全、更灵活、性能更好。 基本介绍 主要特点 类型安全&#xff1a…...

算法打卡第18天

从中序与后序遍历序列构造二叉树 (力扣106题) 给定两个整数数组 inorder 和 postorder &#xff0c;其中 inorder 是二叉树的中序遍历&#xff0c; postorder 是同一棵树的后序遍历&#xff0c;请你构造并返回这颗 二叉树 。 示例 1: 输入&#xff1a;inorder [9,3,15,20,7…...

【深尚想】TPS54618CQRTERQ1汽车级同步降压转换器电源芯片全面解析

1. 元器件定义与技术特点 TPS54618CQRTERQ1 是德州仪器&#xff08;TI&#xff09;推出的一款 汽车级同步降压转换器&#xff08;DC-DC开关稳压器&#xff09;&#xff0c;属于高性能电源管理芯片。核心特性包括&#xff1a; 输入电压范围&#xff1a;2.95V–6V&#xff0c;输…...

前端工具库lodash与lodash-es区别详解

lodash 和 lodash-es 是同一工具库的两个不同版本&#xff0c;核心功能完全一致&#xff0c;主要区别在于模块化格式和优化方式&#xff0c;适合不同的开发环境。以下是详细对比&#xff1a; 1. 模块化格式 lodash 使用 CommonJS 模块格式&#xff08;require/module.exports&a…...

python3GUI--基于PyQt5+DeepSort+YOLOv8智能人员入侵检测系统(详细图文介绍)

文章目录 一&#xff0e;前言二&#xff0e;技术介绍1.PyQt52.DeepSort3.卡尔曼滤波4.YOLOv85.SQLite36.多线程7.入侵人员检测8.ROI区域 三&#xff0e;核心功能1.登录注册1.登录2.注册 2.主界面1.主界面简介2.数据输入3.参数配置4.告警配置5.操作控制台6.核心内容显示区域7.检…...