当前位置： 首页 > news >正文

生信技能55 - WisecondorX分析结果过滤和质控

news 文章来源：https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/140853694 2025/1/16 5:11:14

WisecondorX分析CNV，对每条染色的CNV loss和gain进行分组，对每个组求ratio平均值和zscore平均值，基于该数值对CNV进行质控和过滤，并对连续的CNV进行合并，获得可信的CNV。

WisecondorX基本使用方法以及npz文件转换和reference构建参考文章：

生信技能53 - wiseconrdoX自动化批量npz转换和reference构建

生信技能54 - WisecondorX多线程并行分析CNV

github: https://github.com/CenterForMedicalGeneticsGhent/wisecondorX

在这里插入图片描述

WisecondorX分析结果过滤和质控

import pandas as pd
import os
from pathlib import Path

相关文章：

生信技能55 - WisecondorX分析结果过滤和质控

WisecondorX分析CNV，对每条染色的CNV loss和gain进行分组，对每个组求ratio平均值和zscore平均值，基于该数值对CNV进行质控和过滤，并对连续的CNV进行合并，获得可信的CNV。 WisecondorX基本使用方法以及npz文件转换和reference构建参考文章： 生信技能53 - wiseconrdoX自动…...

编程日记 2024/8/2 6:38:24

待办管理软件电脑版哪个好？待办事项清单app

在快节奏的现代社会中，有效地管理时间和任务变得越来越重要。很多人喜欢使用待办管理软件来协助整理琐碎事务、规划工作任务，以此提升工作效率。特别是对于上班族来说，一款能在电脑上便捷使用的待办软件，更是提升工作效率的得力助…...

编程日记 2024/8/2 6:37:23

【Mind+】掌控板入门教程01 “秀”出我创意

我们的好朋友麦乐佳即将举办一场派对，她要求每个参加派对的人都要佩戴一个可以彰显自己独特创意的装置。可以是会发光的帽子，可以是复古的电子表，还可以是其他有创意的作品。而现在，我们的手边刚好有一块掌控板，它自带…...

编程日记 2024/8/2 6:36:22

操作系统篇--八股文学习第十一天|进程调度算法你了解多少，进程间有哪些通信方式，解释一下进程同步和互斥，以及如何实现进程同步和互斥

进程调度算法你了解多少？ 答： 先来先服务：按照请求的顺序进行调度。 这种调度方式简单，但是能导致较长作业阻塞较短作业。最短作业优先：非抢占式的调度算法，按估计运行时间最短的顺序进行调度。 但是如果…...

编程日记 2024/8/2 6:35:21

慢慢欣赏arm64内核启动6 primary_entry之el2_setup代码第三部分

分析代码 解析完虚拟化部分，我们继续分析启动过程中，对中断控制器的处理 #ifdef CONFIG_ARM_GIC_V3/* GICv3 system register access */mrs x0, id_aa64pfr0_el1ubfx x0, x0, #ID_AA64PFR0_GIC_SHIFT, #4cbz x0, 3fmrs_s x0, SYS_ICC_SRE_EL2orr x0, x…...

编程日记 2024/8/2 6:34:20

初谈Linux多线程--线程控制

文章目录 线程的概述理解线程Linux中的线程重新理解的进程Windows的线程线程的优点线程的缺点理解线程调度成本低 进程VS线程 线程控制创建线程等待线程线程函数传参线程的返回值新线程的返回值新线程返回值错误返回值为类对象 创建多线程线程的终止线程的分离pthread_detach 线…...

编程日记 2024/8/2 6:32:19

文件工具类 - FileUtils

Slf4j Component public class FileUtils {/*** 文件夹复制到指定的文件夹*/SneakyThrowspublic static void copyDir(File source, File target) {if (!target.exists()) {boolean mkdirs target.mkdirs();}if (source.isDirectory()) {File[] files source.listFiles();if …...

编程日记 2024/8/2 6:31:17

Kafka源码剖析-Producer基于内存缓存池分配ByteBuffer

文章目录 在将消息发送到内存缓中区之前做的准备工作发送消息前的准备工作代码示例源码分析1. **消息序列化**2. **元数据准备**3. **分区选择**4. **批处理准备**总结大致浏览一下源码中将消息写入内存缓冲的运行流程源码分析1. **消息序列化和创建记录批次**2. **确定分区**3…...

编程日记 2024/8/2 6:30:16

实习十九：学习笔记

上午 1、构建vue发行版本 [rootserver ~]# cd eleme_web/ [rootserver eleme_web]# npm run buid //项目未执行时运行该命令，创建发行版本 [rootserver eleme_web]# cd dist/ //dist中包含发行版本的所有文件 [rootserver dist]# ls css favicon.ico i…...

编程日记 2024/8/2 6:29:14

OrionX：革新GPU资源管理，助力AI开发团队高效运作

您的AI开发团队是否经常陷入这样的窘境： 人多卡少，GPU资源难以满足每个成员的需求？ 当开发环境中需要变更GPU卡配置时，流程繁琐不堪，不得不关闭容器、重新配置再重启？ 是否曾因GPU卡分配后未被充分利用而…...

编程日记 2024/8/2 6:28:13

RabbitMQ发送者重连、发送者确认

RabbitMQ发送者重连、发送者确认 一、发送者重连 spring:rabbitmq:connection-timeout: 1s #设置MQ的连接超时时间template:retry:enabled: true #开启超时重试机制initial-interval: 1000ms #失败后的初始等待时间multiplier: 1 #失败后下次的等待时长倍数，下次等…...

编程日记 2024/8/2 6:27:11

请转告HPC计算AI计算单位，选对存储事半功倍

U.2 NVMe全闪混合统一存储GS 5000U是Infortrend产品中一款高性能机型。得益于搭载强劲的第五代IntelXeon处理器，以及支持PCIe 5.0、NVMe-oF、100GbE等多种特点，GS 5000U单台块级性能可达50 GB/s的读、20 GB/s的写，以及1300K的IOPS&#xff1b…...

编程日记 2024/8/2 6:26:10

[GYCTF2020]Blacklist1

打开题目 判断注入类型，输入1试试 输入2 输入1 判断为字符型注入 堆叠查询2;show databases;# 然后来输入2; show tables;#来查看数据库的表 然后我们通过FlagHere表来查看列输入2;show columns from FlagHere;# 来查看列 、 重新构造payload：0;HAND…...

编程日记 2024/8/2 6:24:08

Blackcat V2.2付费会员制WordPress资源站主题

Blackcat-付费会员制WordPress资源站主题，该主题是基于简约实用的主题选项框架 Codestar Framework 进行开发的功能强大的付费会员制主题，该主题尤其适合用于搭建付费下载资源网站，比如素材站、软件站、视频教程站等付费资源下载网站。 集成…...

编程日记 2024/8/2 6:22:07

动手学强化学习 第 18 章 离线强化学习 训练代码

基于 https://github.com/boyu-ai/Hands-on-RL/blob/main/%E7%AC%AC18%E7%AB%A0-%E7%A6%BB%E7%BA%BF%E5%BC%BA%E5%8C%96%E5%AD%A6%E4%B9%A0.ipynb 理论 离线强化学习 修改了警告和报错 运行环境 Debian GNU/Linux 12 Python 3.9.19 torch 2.0.1 gym 0.26.2 运行代码 CQL.…...

编程日记 2024/8/2 6:21:05

Python笔试面试题AI答之面向对象常考知识点

Python面向对象面试题面试题覆盖了Python面向对象编程（OOP）的多个重要概念和技巧，包括元类（Metaclass）、自省（Introspection）、面向切面编程（AOP）和装饰器、重载&#xf…...

编程日记 2024/8/2 6:20:05

面试经典算法150题系列-数组/字符串操作之买卖股票最佳时机

买卖股票最佳时机 给定一个数组 prices ，它的第 i 个元素 prices[i] 表示一支给定股票第 i 天的价格。 你只能选择 某一天 买入这只股票，并选择在 未来的某一个不同的日子 卖出该股票。设计一个算法来计算你所能获取的最大利润。 返回你可以从这笔交易…...

编程日记 2024/8/2 6:18:03

安装jdk和tomcat

安装nodejs 1.安装nodejs，这是一个jdk一样的软件运行环境 yum -y list installed|grep epel yum -y install nodejs node -v 2.下载对应的nodejs软件npm yum -y install npm npm -v npm set config .....淘宝镜像 3.安装vue/cli command line interface 命令行接…...

编程日记 2024/8/2 6:17:01

mongodb 备份还原

### 加入 MongoDB 官方 repositoryecho [mongodb-org-4.4] nameMongoDB Repository baseurlhttps://repo.mongodb.org/yum/redhat/$releasever/mongodb-org/4.4/x86_64/ gpgcheck1 enabled1 gpgkeyhttps://www.mongodb.org/static/pgp/server-4.4.asc| tee /etc/yum.repos.d/mo…...

编程日记 2024/8/2 6:16:00

day27——homework

1、使用两个线程完成两个文件的拷贝&#xff0c;分支线程1拷贝前一半&#xff0c;分支线程2拷贝后一半&#xff0c;主线程回收两个分支线程的资源 #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <pthread.h> #include <fcntl.h> #include <uni…...

编程日记 2024/8/2 6:14:58

shell脚本自动化部署

1、自动化部署DNS [rootweb ~]# vim dns.sh [roottomcat ~]# yum -y install bind-utils [roottomcat ~]# echo "nameserver 192.168.8.132" > /etc/resolv.conf [roottomcat ~]# nslookup www.a.com 2、自动化部署rsync [rootweb ~]# vim rsync.sh [rootweb ~]# …...

编程日记 2024/8/2 6:13:57

C语言| 文件操作详解（二）

目录 四、有关文件的随机读写函数 4.1 fseek 4.2 ftell 4.3 rewind 五、判定文件读取结束的标准与读写文件中途发生错误的解决办法 5.1 判定文件读取结束的标准 5.2 函数ferror与feof 5.2.1 函数ferror 5.2.2 函数feof 在上一章中&#xff0c;我们主要介绍了文件类型…...

编程日记 2024/8/2 6:12:56

保证项目如期上线，测试人能做些什么？

要保证项目按照正常进度发布&#xff0c;需要整个研发团队齐心协力。 有很多原因都可能会造成项目延期。 1、产品经理频繁修改需求 2、开发团队存在技术难题 3、测试团队测不完 今天我想跟大家聊一下&#xff0c;测试团队如何保证项目按期上线&#xff0c;以及在这个过程中可能…...

编程日记 2024/8/2 6:11:56

【杂谈】在大学如何学得计算机知识，浅谈大一经验总结

大学新生的入门经验简谈 我想在学习编程这条路上&#xff0c;很多同学感到些许困惑&#xff0c;摸爬滚打一年&#xff0c;转眼就要进入大二学习了&#xff0c;下面浅谈个人经验与反思总结。倘若说你是迷茫的&#xff0c;希望这点经验对你有帮助&#xff1b;但倘若你有更好的建…...

编程日记 2024/8/2 6:10:54

Superset二次开发之柱状图实现同时显示百分比、原始值、汇总值的功能

背景 柱状图贡献模式选择行，堆积样式选择Stack，默认展示百分比，可以展示每个堆积的百分比，但是无法实现同时展示百分比、原始值、汇总值的效果。借助Tooltip可以实现，但是不直观。 柱状图来自Echarts插件，可以先考虑Echarts的柱状图如何实现此需求，再研究Superset项目的…...

编程日记 2024/8/2 6:09:53

堆的创建和说明

文章目录 目录 文章目录 前言 小堆&#xff1a; 大堆&#xff1a; 二、使用步骤 1.创建二叉树 2.修改为堆 3.向上调整 结果实现 总结 前言 我们已经知道了二叉树的样子&#xff0c;但是一般的二叉树是没有什么意义的&#xff0c;所以我们会使用一些特殊的二叉树来进行实现&a…...

编程日记 2024/8/2 6:08:52

【玩转python】入门篇day14-函数

1、函数的定义 函数通过def定义&#xff0c;包括函数名、参数、返回值 # 定义函数 def test(a,b): # a,b表示形式参数print(a b)#函数体(具体的功能)return a*b #返回值# 函数调用 test(12,43) # 12和43表示实际参数,在调用函数时,会替换形式参数a,b下面这个展示了稍微复…...

编程日记 2024/8/2 6:06:50

uni-app 将base64图片转换成临时地址

function getTempFilePath(base64Data) {return new Promise((resolve, reject) > {const fs uni.getFileSystemManager()base64Data base64Data.split(,)[1]const fileName temp_image_ Date.now() .png // 自定义文件名&#xff0c;可根据需要修改const filePath un…...

编程日记 2024/8/2 6:05:48

C#用Socket实现TCP客户端

1、TCP客户端实现代码 using System; using System.Collections.Generic; using System.Linq; using System.Net; using System.Net.Sockets; using System.Text; using System.Threading; using System.Threading.Tasks;namespace PtLib.TcpClient {public delegate void Tcp…...

编程日记 2024/8/2 6:04:47

jmeter-beanshell学习15-输入日期，计算前后几天的日期

又遇到新问题了&#xff0c;想要根据获取的日期&#xff0c;计算出前面两天的日期。网上找了半天&#xff0c;全都是写获取当天日期&#xff0c;然后计算昨天的日期&#xff0c;照葫芦画瓢也没改出来想要的&#xff0c;最后求助了开发同学。 先放上网上获取当天&#xff0c;计…...

编程日记 2024/8/2 6:03:46

建设银行上海黄浦支行网站/应用关键词优化

本文介绍如何搭建四节点的Oracle Linux 7集群以及oozie的High Availability。环境如下图&#xff1a;一、创建HA集群1、安装集群软件包分别在4个节点上安装&#xff0c;如下&#xff1a; [roothdp01 ~]# yum install pcs fence-agents-all -y [roothdp02 ~]# yum install pcs…...

编程日记 2025/1/16 3:52:04

郑州 高端网站建设/镇江推广公司

多层感知机解决了之前无法模拟异或逻辑的缺陷&#xff0c;同时更多的层数也让网络更能够刻画现实世界中的复杂情形。理论上而言&#xff0c;参数越多的模型复杂度越高&#xff0c;“容量”也就越大&#xff0c;也就意味着它能完成更复杂的学习任务。多层感知机给我们带来的启示…...

编程日记 2025/1/16 3:40:58

网站制作厂家/网站的推广方法

1清楚一个项目的工作量有多少。 2了解一个项目中每一个组成部分的工作难度是怎么样的。 3对项目中每一个组成部分需要多少时间来完成心中要有数。 4熟悉同伴们的工作特点和强项所在&#xff0c;有针对性的分派任务。 5一定要分工明确&#xff0c;让每一个人清楚知道自己要完…...

编程日记 2025/1/16 3:09:30

如何将vs做的网站备份出来6/软文之家

我做了一個傻事&#xff0c;要在Server上新增一張網卡&#xff0c;可是因為一直無法啟動&#xff0c; 所以很自然的以為CentOS 6又多了其他的設定要求&#xff0c; 因此查了兩天的資料&#xff0c;也試過很多方式&#xff0c;但都沒有效用。 今天早上心血來潮&#xff0c;想說用…...

编程日记 2025/1/16 0:34:31

拖拽做网站/成都关键词seo推广电话

1.多对多user roleu User.firstrole Role.first插入u.roles << roleu.save更新u.roles []u.roles << roleu.update()2.group将多条记录合并后用于计算转载于:https://www.cnblogs.com/znsongshu/p/6179459.html...

编程日记 2025/1/15 23:34:18

沂源网站开发/上海推广服务

&#xff08;1&#xff09;第一个程序“”“Hello World” 实现python环境打印输出&#xff1a;Hello World 程序&#xff1a; print("Hello World") 数据类型转换 数据类型&#xff1a;int整形&#xff0c;str字符型&#xff0c;不同类性的数据不能相加、减。 正确&…...

编程日记 2025/1/15 20:58:35