手里有病理切片+单细胞测序的数据,如何开展医工交叉的研究?
小罗碎碎念
这一期推文研究一个问题:病理如何与单细胞结合?
病理与单细胞的结合,时常出现在今年的各大顶刊中。

关于这一领域的研究,其实19年就开始了。我把部分低质量的文献做了剔除,但是也基本能反应这一领域的受关注程度。
| 年份 | 论文数量 |
|---|---|
| 2019 | 3 |
| 2020 | 49 |
| 2021 | 91 |
| 2022 | 85 |
| 2023 | 104 |
| 2024 | 273 |
除了关注实验研究,我们还应该关注这一领域的综述。
前面介绍了病理+单细胞的总体论文发表情况,这一部分再来盘一下这一领域的综述发表情况(所以上一个表格会包含这一个表格的内容)。

在综述发表的年份上,数据倒是没有明显的区别。
| 年份 | 数量 |
|---|---|
| 2020 | 7 |
| 2021 | 15 |
| 2022 | 8 |
| 2023 | 8 |
| 2024 | 8 |
入门书籍:机器学习在基因组学中的应用
之前的推文中主要介绍的都是病理组学的内容,所以大部分同学/老师对于机器学习在基因组学中的应用应该都比较陌生,所谓我也挑选了四本相关的高质量书籍分享给大家。
第一本是通过R语言来完成数据的分析,剩余的三本则要借助Python来辅助完成数据的分析,大家各取所需。

原文pdf我会上传到知识星球的【入门书籍】专栏,感兴趣的可以前往获取!
入门书籍:机器学习在病理组学中的应用
关于病理组学的内容,我更多推荐的都是一些顶刊,书籍的话想对较少,不过经过我的一番努力,也找到了三本,其中第二本不仅有病理组学的内容,还有影像组学的内容,值得大家花一些时间好好研究一下!

同样的,上述三本书的pdf版本我也会上传到知识星球的【入门书籍】专栏,感兴趣的可以前往获取!
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