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[lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线

一区Script Materialia期刊:多主元素合金中的短程有序域扩散一文,研究了CrCoNi合金和MoNbTa合金中原子的扩散过程,文中有出现如下图所示的原子运动轨迹线。这种原子运动轨迹线我们在研究扩散过程中常常会用到。

[lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线的图1

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图参考自:Bin Xing, Xinyi Wang, William J. Short-range order localizing diffusion in multi-principal element alloys,Scripta Materialia, 2022

本文将介绍如何利用OVITO软件再现文章的不同颜色的原子的轨迹图

1、打开OVITO界面并且导入数据文件

[lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线的图3

[lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线的图4

2、选择该原子模型的某一面,我选择的视角为(left)

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3、开始将该原子面开始删除为只包含一层原子的模型,先采用Expression selection,并且在Boolean expression中选择Position.X <=1

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4、采用Invert selection 进行反向选择

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5、采用Delete selected 将反选择好的原子删除掉,得到了只有一层原子面

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6、选择Manual selection中的Pick对该原子表面的其中一个原子进行标定

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7,选择Generate trajectory lines,选择加载的原子轨迹为5000帧,加载完之后在Tracjectory display中修改轨迹的颜色以及线宽,如下

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得到该选定原子的5000帧之前的全部原子轨迹

8,若想得到其他原子不同颜色的轨迹,重复上述操作7,本次操作只选择5种不同颜色的原子轨迹图

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由于所选择的原子并非在原子表面移动,所以,根据实际情况而定,这样就初步得到3个不同颜色的原子轨迹

9、将这一层原子的颜色调整成一种颜色,(根据个人喜好来),然后调整原子的半径大小

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最后,有相关需要欢迎通过公众号“320科技工作室”与我们联系

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